农业企业进行质量管理体系认证存在的问题
1.认证目的不正确
农业企业对ISO9001标准引人，实施质量管理体系认证，各个企业对于“自愿”认证的目的各有不同，而企业管理者对于认证的意识和对认证工作的重视程度决定了认证有效性的程度。大部分都是因为外部需要而非“自愿”，归纳起来大致有如下目的:一是申报各种称号需要。对于质量管理体系认证行为，从申请的形式和程序上看是属干自愿性质，但是随着市场开拓和消费者对农副产品品质的要求不断提高，促使许多农业企业需要进行申报绿色食品、无公害农产品和有机食品等的认证，特别是目前全面实施品牌战略，需要申报市级、省级、国家级的名牌产品，那么通过认证是申报名牌产品必备的门槛。二是开拓国际市场需要。随着农副产品进人国际市场，许多进口国家对输人产品的生产过程实施质量管理体系，并通过认证来保证其产品质量。三是政府推动要求企业认证。质量管理体系认证实际上是企业自愿行为，但是随着政府大力推动品牌战略，希望企业在质量管理水平上台阶，往往会以各种形式来要求企业推行IS09000标准，许多农业企业也都是在行政职能部门的“推动”下申请认证。
2.认证过程流于形式
农业企业的技术人员和操作人员相对于工业企业来说，其技术水平、文化素质等都比较欠缺，因此在贯标、推行和实施中只是注重软件资料文件的完善，以应付认证审核，而这些工作都是由中介咨询人员来做，许多企业将咨询人员都作为自己企业的管理代表，本应该由企业自己做的事往往由咨询人员通包，甚至出现一个咨询人员同时兼任多家企业管理代表的现象，在审核时应付通过，拿到认证证书后企业还是老一套。因此，在推行质量管理体系认证的实施中，实际上都演变为审核人员对咨询人员的审核，而不是真正对企业生产管理过程的审核。另外，一些认证机构在审核过程中也是走过场，只要按标准要求的资料文件齐全即可审核通过，而对实际控制效果却不闻不问。如此自然达不到认证效果。
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3.认证过后不落实
许多企业为了拿到质量管理体系认证证书而被动申请认证，在产品生产的每个环节程序中，其并没有按照IS09000标准休系中的要求卖施控制，从而使许多农业企业的质量管理体系认证证书成为企业的招牌，其质量管理水平值得怀疑。
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