OA办公系统有很多功能模块，有工作流、知识管理、人力资源管理、公文管理、档案管理、CRM系统、通讯工具管理、项目管理等，企业应该清楚每一个功能模块具体能实现什么、达到什么样的效果。然后还要与企业自身所需功能进行对比，作为选型的参考因素。
其次，从OA办公系统的整体来看。OA办公系统中有行政、人事、财务、产品等多个功能领域组成，每个功能模块或子系统之间都不是相互独立的，能够进行相互的联系和沟通，实现企业协同办公和协同管理。在OA办公系统的运行过程中，部门与部门之间、人与人之间的沟通是必不可少的，所以企业管理层能够通过OA办公系统对企业实现全面和整体的管理。
最后从OA办公系统的本质来看，OA办公系统的本质是对企业办公流程和业务流程的管控。现在市场上有很多的软件供企业使用，如ERP、CRM等，这些系统包括OA办公系统都能够对数据进行有效的计算和分析，而OA办公系统不是一个重在数据分析和计算的系统，而是重在对过程的管理和控制，使企业的办公流程和业务流程灵活的运行。
