多数蜥蜴昼间活动，壁虎多在薄暮至破晓之间活动，并能发出大声(而大部分蜥蜴不能发声)。蜥蜴的捕食方式为静候或搜寻。许多蜥蜴能将尾部自割，断下的尾能迅速扭动以分散捕食者的注意，蜥蜴得以逃脱。许多蜥蜴有领域行为(包括领域表演)或求偶表演。许多种有股孔，可能用来分泌化学物质以吸引异性。蜥蜴对于人的经济意义不大。某些鬣蜥可食，有些可制革。壁虎栖于居室，可捕害虫，但可能传播沙门氏菌。蜥蜴是生物学的重要研究材料，又常饲为玩赏动物。
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多数蜥蜴以昆虫及部分啮齿类为食，偶食家禽，其牙尖锐，具3个牙尖。草食性者(如鬣蜥)的牙冠宽，呈叶状，具锯齿状切缘。以软体动物、甲壳动物为食者(如凯门蜥属〔Dracaena〕)于腭后部有钝圆的牙用以碾碎。美国西南部的希拉毒蜥(Gila monster)及其墨西哥近缘种(Heloderma属)有毒，于激怒时方咬人，但罕致命，其下腭各牙内侧有纵沟或褶用以引出毒液。多数蜥蜴的牙生于上腭骨、前腭骨及牙骨的边缘，少数种生于腭上。胚胎期前腭骨上有「卵牙」，从吻部向前突出，用于钻破卵壳，孵出后即退化。牙着生的方式多为侧生式，部分种为顶生式，避役的两眼可独立运动。许多蜥蜴有盐腺用以排出矿物质盐。肩带存在。
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多数蜥蜴具四足，后肢肌肉有力，能迅速奔跑及迅速改变跑动方向，Cnemidophorus属时速达24公里(15哩)。有几科蜥蜴身体延长，四肢缩短，乃至无肢体。壁虎、鬣蜥属(Uta)及Acanthodactylus属的趾上多缘饰以增加其表面积并防止陷入沙中，壁虎能在垂直的玻璃板上爬行。避役每足5趾，借皮肤构成的蹼分为内外两组，在后肢外侧3趾、内侧2趾各成一组，前肢反之，适雄体具成对的交接器官──半阴茎。王蜥能跑过短距离的水面。