在《关于农村城市化历史遗留违法建筑的处理决定》发布以后，全国各地针对于小产权房的发展决定也在逐步展开并实施，而对于东莞这个城市的小产权房并没有真正去实行，而在东莞有更多的人认为东莞小产权房的“合法化”将为小产权房开拓先例，但是从后期的结果来看，东莞小产权房并没有作出最终的决定，对于小产权房的“合法化”也并没有统一的公开。
在全国市场中，大面积的小产权房大量挤压造成了经济和资源的浪费，所以政府不得不重视这个问题，而另一方面，从东莞的小产权房处理中增加城市物业税可能会在各个城市进行推广实行。
东莞小产权房涉及到土地流转、土地性质变更以及国家土地资源规划等，其过程不仅长久而且难度极大，所以我们认为，对于深圳小产权房的最终处理办法将会是以下几种：
1、补交地价，获得转正
对于已经建设完毕而且对于城市的影响力极大的深圳小产权房，在不能够拆除、回收的情况下，最好的处理办法就是实行转正，通过对土地的低价补让公民获得正规而统一的土地资产。
2、政府出钱回收
东莞小产权房是由政府或者农村集体建立，是政府出面的城市化建设和楼盘的销售，那么当公转化为私、私在转化为公的办法就是实行回收，但是依旧当今的土地资源价格，估计回收起来难度较大。
3、针对各个城市出台不同管理办法
从全国各地的小产权房来看，小产权房的数量近年只增不降，对于某些城市为了获得经济而肆意规划城市，造成了土地资源的流失及小产权房的产出过剩，对小产权房处理的最好办法就是实行不同城市不同管理，不同情况不同制度的办法。